Gıda Mikrobiyolojisi, bilimsel gelişmelere açık, modern ve uygulamalı bir bilim dalıdır. Aynı zamanda teknolojik yeniliklerin en hızlı bir şekilde uygulandığı alanlardan birisidir. Bu anlamda Gıda Mikrobiyolojisinin altın çağına girdiği söylenebilir. Gıda Mikrobiyolojisinin temelini oluşturan her üç alanında da – faydalı mikroorganizmaların, bozulma yapan mikroorganizmaların ve patojenlerin mikrobiyolojisi – gelişmeler inanılmaz bir hızla devam etmektedir. Bir zamanlar sadece koloni sayılarak ve koloni özelliklerinin incelenmesine dayalı olarak yapılan basit işlemlerin yerini günümüzde, genom dizilemeleri veya biyosensörler kullanılarak yapılan daha sofistike yöntem ve uygulamalar almıştır.